MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 2549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008383	CG	3	6	54	59	0 %	0 %	50 %	50 %	116255068
2	NC_008383	TC	3	6	63	68	0 %	50 %	0 %	50 %	116255068
3	NC_008383	GC	3	6	71	76	0 %	0 %	50 %	50 %	116255068
4	NC_008383	TCG	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255068
5	NC_008383	CGA	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255068
6	NC_008383	CAC	2	6	317	322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255068
7	NC_008383	ACG	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255068
8	NC_008383	GCT	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255068
9	NC_008383	TTGATC	2	12	449	460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116255068
10	NC_008383	CGTT	2	8	537	544	0 %	50 %	25 %	25 %	116255068
11	NC_008383	ATG	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255068
12	NC_008383	GCG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255068
13	NC_008383	TCT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255068
14	NC_008383	GAC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255068
15	NC_008383	GTC	3	9	742	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255068
16	NC_008383	CCG	2	6	803	808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255068
17	NC_008383	GATGT	2	10	838	847	20 %	40 %	40 %	0 %	116255068
18	NC_008383	CTG	2	6	862	867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255068
19	NC_008383	CGT	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255068
20	NC_008383	ACC	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255068
21	NC_008383	CT	3	6	1076	1081	0 %	50 %	0 %	50 %	116255068
22	NC_008383	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255068
23	NC_008383	ATC	2	6	1176	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255068
24	NC_008383	ATG	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255068
25	NC_008383	CCT	2	6	1335	1340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255069
26	NC_008383	TCA	2	6	1363	1368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255069
27	NC_008383	CGAT	2	8	1450	1457	25 %	25 %	25 %	25 %	116255069
28	NC_008383	CCGT	2	8	1513	1520	0 %	25 %	25 %	50 %	116255069
29	NC_008383	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255069
30	NC_008383	GAG	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255069
31	NC_008383	TCGC	2	8	1562	1569	0 %	25 %	25 %	50 %	116255069
32	NC_008383	GCA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255069
33	NC_008383	GGC	2	6	1677	1682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255069
34	NC_008383	GC	3	6	1757	1762	0 %	0 %	50 %	50 %	116255069
35	NC_008383	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255069
36	NC_008383	GCTG	2	8	1848	1855	0 %	25 %	50 %	25 %	116255069
37	NC_008383	GAC	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255069
38	NC_008383	TGC	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255069
39	NC_008383	ATC	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255069
40	NC_008383	TGC	2	6	1992	1997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255069
41	NC_008383	GC	4	8	2005	2012	0 %	0 %	50 %	50 %	116255069
42	NC_008383	TCT	2	6	2013	2018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255069
43	NC_008383	TGA	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255069
44	NC_008383	GAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255069
45	NC_008383	AAG	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255069
46	NC_008383	TGA	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255069
47	NC_008383	AAG	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255069
48	NC_008383	AAG	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255069
49	NC_008383	ACG	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255070
50	NC_008383	GCG	2	6	2487	2492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255070
51	NC_008383	TTC	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255070
52	NC_008383	GTC	2	6	2692	2697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255070
53	NC_008383	TGG	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255070
54	NC_008383	ATC	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255070
55	NC_008383	AAG	2	6	2840	2845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255070
56	NC_008383	CTT	2	6	2884	2889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255070
57	NC_008383	GC	4	8	2890	2897	0 %	0 %	50 %	50 %	116255070
58	NC_008383	GCT	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255070
59	NC_008383	GATTG	2	10	3034	3043	20 %	40 %	40 %	0 %	116255070
60	NC_008383	GTTC	2	8	3078	3085	0 %	50 %	25 %	25 %	116255070
61	NC_008383	CGA	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255070
62	NC_008383	CTT	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255070
63	NC_008383	GAA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255070
64	NC_008383	AGA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255070
65	NC_008383	CGGA	2	8	3206	3213	25 %	0 %	50 %	25 %	116255070
66	NC_008383	AAG	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255070
67	NC_008383	TGCC	2	8	3357	3364	0 %	25 %	25 %	50 %	116255070
68	NC_008383	TGG	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255070
69	NC_008383	ATG	2	6	3415	3420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255070
70	NC_008383	GCG	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255070
71	NC_008383	AGG	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255070
72	NC_008383	GCG	2	6	3505	3510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255070
73	NC_008383	CGG	2	6	3554	3559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255070
74	NC_008383	G	6	6	3558	3563	0 %	0 %	100 %	0 %	116255070
75	NC_008383	GCG	2	6	3591	3596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255070
76	NC_008383	CCGA	2	8	3829	3836	25 %	0 %	25 %	50 %	116255071
77	NC_008383	ATC	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255071
78	NC_008383	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	116255071
79	NC_008383	TGG	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255071
80	NC_008383	TCAA	2	8	3925	3932	50 %	25 %	0 %	25 %	116255071
81	NC_008383	GAA	2	6	4005	4010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255071
82	NC_008383	GAC	2	6	4033	4038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255071
83	NC_008383	CA	3	6	4044	4049	50 %	0 %	0 %	50 %	116255071
84	NC_008383	AGTCCG	2	12	4127	4138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255071
85	NC_008383	ACTC	2	8	4140	4147	25 %	25 %	0 %	50 %	116255071
86	NC_008383	GAA	2	6	4158	4163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255071
87	NC_008383	CAG	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255071
88	NC_008383	CAGG	2	8	4219	4226	25 %	0 %	50 %	25 %	116255071
89	NC_008383	TCTT	2	8	4241	4248	0 %	75 %	0 %	25 %	116255071
90	NC_008383	CG	3	6	4257	4262	0 %	0 %	50 %	50 %	116255071
91	NC_008383	ACC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255071
92	NC_008383	ACCG	2	8	4374	4381	25 %	0 %	25 %	50 %	116255071
93	NC_008383	GTT	2	6	4405	4410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255071
94	NC_008383	GAGC	2	8	4591	4598	25 %	0 %	50 %	25 %	116255071
95	NC_008383	GCG	2	6	4615	4620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255071
96	NC_008383	TGA	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255071
97	NC_008383	GCA	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255071
98	NC_008383	CGA	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255071
99	NC_008383	CTCA	2	8	4849	4856	25 %	25 %	0 %	50 %	116255071
100	NC_008383	TCAAA	2	10	4912	4921	60 %	20 %	0 %	20 %	116255071
101	NC_008383	AG	3	6	4967	4972	50 %	0 %	50 %	0 %	116255071
102	NC_008383	GTC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255071
103	NC_008383	CGA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255071
104	NC_008383	ACC	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255071
105	NC_008383	CTG	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255071
106	NC_008383	TTCG	2	8	5164	5171	0 %	50 %	25 %	25 %	116255071
107	NC_008383	CAA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255071
108	NC_008383	CAC	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255071
109	NC_008383	AT	3	6	5307	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	116255071
110	NC_008383	AGCC	2	8	5340	5347	25 %	0 %	25 %	50 %	116255071
111	NC_008383	TTG	2	6	5359	5364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255071
112	NC_008383	TCAC	2	8	5383	5390	25 %	25 %	0 %	50 %	116255071
113	NC_008383	CGG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255071
114	NC_008383	GTCCA	2	10	5443	5452	20 %	20 %	20 %	40 %	116255071
115	NC_008383	CTT	2	6	5485	5490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255071
116	NC_008383	TCCT	2	8	5545	5552	0 %	50 %	0 %	50 %	116255071
117	NC_008383	CGA	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255071
118	NC_008383	TTTC	2	8	5710	5717	0 %	75 %	0 %	25 %	116255071
119	NC_008383	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255071
120	NC_008383	TGAT	2	8	5816	5823	25 %	50 %	25 %	0 %	116255071
121	NC_008383	CCACA	2	10	5833	5842	40 %	0 %	0 %	60 %	116255071
122	NC_008383	GCGAC	2	10	6008	6017	20 %	0 %	40 %	40 %	116255071
123	NC_008383	TC	3	6	6063	6068	0 %	50 %	0 %	50 %	116255071
124	NC_008383	GCAG	2	8	6091	6098	25 %	0 %	50 %	25 %	116255071
125	NC_008383	GAC	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255071
126	NC_008383	ATC	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255071
127	NC_008383	GAATG	2	10	6243	6252	40 %	20 %	40 %	0 %	116255071
128	NC_008383	ATTTT	2	10	6272	6281	20 %	80 %	0 %	0 %	116255071
129	NC_008383	TTCA	2	8	6312	6319	25 %	50 %	0 %	25 %	116255071
130	NC_008383	CCG	2	6	6351	6356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255071
131	NC_008383	AAC	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255071
132	NC_008383	TCT	2	6	6512	6517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255071
133	NC_008383	GAA	2	6	6538	6543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255071
134	NC_008383	GCA	2	6	6864	6869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255072
135	NC_008383	GCGG	2	8	6937	6944	0 %	0 %	75 %	25 %	116255072
136	NC_008383	GA	3	6	7057	7062	50 %	0 %	50 %	0 %	116255072
137	NC_008383	TTCT	2	8	7122	7129	0 %	75 %	0 %	25 %	116255072
138	NC_008383	GCA	2	6	7206	7211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255072
139	NC_008383	GAA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255072
140	NC_008383	CGC	2	6	7267	7272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255072
141	NC_008383	CAT	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255072
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143	NC_008383	CCT	2	6	7370	7375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255072
144	NC_008383	GTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255072
145	NC_008383	CGG	2	6	7544	7549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255072
146	NC_008383	GGAT	2	8	7570	7577	25 %	25 %	50 %	0 %	116255072
147	NC_008383	CACG	2	8	7683	7690	25 %	0 %	25 %	50 %	116255072
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149	NC_008383	AAG	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255072
150	NC_008383	AGCC	2	8	7767	7774	25 %	0 %	25 %	50 %	116255072
151	NC_008383	GTTG	2	8	7777	7784	0 %	50 %	50 %	0 %	116255072
152	NC_008383	ACG	2	6	7839	7844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255072
153	NC_008383	GCG	2	6	7907	7912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255072
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155	NC_008383	TCG	2	6	8093	8098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255072
156	NC_008383	ACG	2	6	8186	8191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255072
157	NC_008383	CCGATC	2	12	8273	8284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116255072
158	NC_008383	GAA	2	6	8298	8303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255072
159	NC_008383	CCTG	2	8	8363	8370	0 %	25 %	25 %	50 %	116255072
160	NC_008383	TTCA	2	8	8607	8614	25 %	50 %	0 %	25 %	116255073
161	NC_008383	CCG	2	6	8648	8653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255073
162	NC_008383	CT	3	6	8655	8660	0 %	50 %	0 %	50 %	116255073
163	NC_008383	CTG	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255073
164	NC_008383	CGA	2	6	8776	8781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255073
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181	NC_008383	G	6	6	9901	9906	0 %	0 %	100 %	0 %	116255074
182	NC_008383	TTCA	2	8	9964	9971	25 %	50 %	0 %	25 %	116255074
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249	NC_008383	GGC	2	6	13140	13145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255076
250	NC_008383	GCG	2	6	13146	13151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255076
251	NC_008383	AG	3	6	13174	13179	50 %	0 %	50 %	0 %	116255076
252	NC_008383	GGGGAG	2	12	13185	13196	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	116255076
253	NC_008383	GCTG	2	8	13437	13444	0 %	25 %	50 %	25 %	116255077
254	NC_008383	TCT	2	6	13560	13565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255077
255	NC_008383	TGA	2	6	13572	13577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255077
256	NC_008383	GCC	2	6	13582	13587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255077
257	NC_008383	CGG	2	6	13619	13624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255078
258	NC_008383	ACT	2	6	13683	13688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255078
259	NC_008383	CTG	2	6	13694	13699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255078
260	NC_008383	AGC	4	12	13718	13729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255078
261	NC_008383	CG	3	6	14012	14017	0 %	0 %	50 %	50 %	116255079
262	NC_008383	CG	3	6	14040	14045	0 %	0 %	50 %	50 %	116255079
263	NC_008383	G	6	6	14108	14113	0 %	0 %	100 %	0 %	116255079
264	NC_008383	GAG	2	6	14182	14187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255079
265	NC_008383	TGA	2	6	14271	14276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255079
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267	NC_008383	TC	3	6	14344	14349	0 %	50 %	0 %	50 %	116255079
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272	NC_008383	TCT	2	6	14637	14642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255079
273	NC_008383	GAG	2	6	14749	14754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255079
274	NC_008383	CGT	2	6	14775	14780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255079
275	NC_008383	CGGCG	2	10	14825	14834	0 %	0 %	60 %	40 %	116255079
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386	NC_008383	CT	3	6	22509	22514	0 %	50 %	0 %	50 %	116255087
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388	NC_008383	CGG	2	6	22528	22533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255087
389	NC_008383	CGA	2	6	22561	22566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255087
390	NC_008383	TG	3	6	22577	22582	0 %	50 %	50 %	0 %	116255087
391	NC_008383	TGT	2	6	22588	22593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255087
392	NC_008383	GCTG	2	8	22614	22621	0 %	25 %	50 %	25 %	116255087
393	NC_008383	CCG	2	6	22678	22683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255087
394	NC_008383	CGC	2	6	22709	22714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255087
395	NC_008383	GGC	2	6	22780	22785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255087
396	NC_008383	GGA	2	6	22846	22851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255087
397	NC_008383	CGA	2	6	22921	22926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255087
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399	NC_008383	GAA	2	6	22960	22965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255087
400	NC_008383	ACG	2	6	22995	23000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255087
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404	NC_008383	CAT	2	6	23263	23268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255088
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412	NC_008383	GTC	2	6	23540	23545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255088
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424	NC_008383	AAGG	2	8	24133	24140	50 %	0 %	50 %	0 %	116255089
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498	NC_008383	TCG	2	6	27963	27968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255091
499	NC_008383	GCAGG	2	10	28141	28150	20 %	0 %	60 %	20 %	116255091
500	NC_008383	TCGA	2	8	28187	28194	25 %	25 %	25 %	25 %	116255092

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